研究發現，不同的地層中埋藏著不同類型的生物化石：埋藏于較淺地層中的化石與現代生物結構比較相似，埋藏于較深地層中的化石與現代生物結構差別較大，并且越是古老的地層中發掘的生物化石結構越簡單、低等，水生生物的化石越多；越是晚期的地層中發掘的生物化石結構越復雜、高等，陸生生物化石越多。

　　化石在地層中出現的先后順序，說明了生物的進化歷程和進化趨勢：由簡單到復雜、由低等到高等、由水生到陸生逐漸進化而來的，因此化石是研究進化的主要證據。