菏澤學(xué)院的前身是創(chuàng)建于1949年的冀魯豫區(qū)第二師范學(xué)校，歷史上曾更名為平原省立菏澤師范學(xué)校、山東省菏澤第一師范學(xué)校、菏澤師范專科學(xué)校。2002年，菏澤師范專科學(xué)校、菏澤教育學(xué)院、菏澤廣播電視大學(xué)3所學(xué)校合并，同時并入菏澤師范學(xué)校、菏澤農(nóng)業(yè)學(xué)校，籌建菏澤學(xué)院。2004年，教育部正式批準更名為菏澤學(xué)院。2011年，單縣幼兒師范學(xué)校、鄆城幼兒師范學(xué)校并入菏澤學(xué)院。2017年，學(xué)校成為省級碩士培育建設(shè)單位。